MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 4440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008511	CT	3	6	192	197	0 %	50 %	0 %	50 %	116332446
2	NC_008511	A	8	8	228	235	100 %	0 %	0 %	0 %	116332446
3	NC_008511	T	7	7	377	383	0 %	100 %	0 %	0 %	116332446
4	NC_008511	GA	3	6	456	461	50 %	0 %	50 %	0 %	116332446
5	NC_008511	CT	3	6	462	467	0 %	50 %	0 %	50 %	116332446
6	NC_008511	ATC	2	6	496	501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332446
7	NC_008511	TCG	2	6	542	547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332446
8	NC_008511	ATT	2	6	562	567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332446
9	NC_008511	CAA	2	6	613	618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332446
10	NC_008511	A	7	7	634	640	100 %	0 %	0 %	0 %	116332446
11	NC_008511	AATC	2	8	642	649	50 %	25 %	0 %	25 %	116332446
12	NC_008511	ACTCA	2	10	679	688	40 %	20 %	0 %	40 %	116332446
13	NC_008511	ACA	2	6	818	823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332446
14	NC_008511	GAG	2	6	862	867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332446
15	NC_008511	CT	3	6	901	906	0 %	50 %	0 %	50 %	116332447
16	NC_008511	TTC	2	6	969	974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332447
17	NC_008511	A	7	7	1003	1009	100 %	0 %	0 %	0 %	116332447
18	NC_008511	ACT	2	6	1048	1053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332447
19	NC_008511	CCAA	2	8	1054	1061	50 %	0 %	0 %	50 %	116332447
20	NC_008511	CAAAA	2	10	1071	1080	80 %	0 %	0 %	20 %	116332447
21	NC_008511	AGA	2	6	1118	1123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332447
22	NC_008511	GAA	2	6	1247	1252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332447
23	NC_008511	CT	3	6	1311	1316	0 %	50 %	0 %	50 %	116332447
24	NC_008511	CTT	2	6	1346	1351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332447
25	NC_008511	AGA	2	6	1372	1377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332447
26	NC_008511	AAG	2	6	1392	1397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332447
27	NC_008511	ATTT	2	8	1473	1480	25 %	75 %	0 %	0 %	116332447
28	NC_008511	A	7	7	1615	1621	100 %	0 %	0 %	0 %	116332447
29	NC_008511	GAA	2	6	1652	1657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332447
30	NC_008511	A	6	6	1685	1690	100 %	0 %	0 %	0 %	116332447
31	NC_008511	A	6	6	1700	1705	100 %	0 %	0 %	0 %	116332447
32	NC_008511	TA	3	6	1714	1719	50 %	50 %	0 %	0 %	116332447
33	NC_008511	TTC	2	6	2125	2130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332448
34	NC_008511	AACT	2	8	2258	2265	50 %	25 %	0 %	25 %	116332448
35	NC_008511	A	6	6	2299	2304	100 %	0 %	0 %	0 %	116332448
36	NC_008511	ATT	2	6	2366	2371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332448
37	NC_008511	G	6	6	2434	2439	0 %	0 %	100 %	0 %	116332448
38	NC_008511	TTCC	2	8	2468	2475	0 %	50 %	0 %	50 %	116332448
39	NC_008511	AAT	2	6	2524	2529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332448
40	NC_008511	CAA	2	6	2543	2548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332448
41	NC_008511	AGA	2	6	2577	2582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332448
42	NC_008511	A	6	6	2819	2824	100 %	0 %	0 %	0 %	116332448
43	NC_008511	GAA	2	6	2843	2848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332448
44	NC_008511	C	6	6	2922	2927	0 %	0 %	0 %	100 %	116332448
45	NC_008511	GAA	2	6	2956	2961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332448
46	NC_008511	A	7	7	2987	2993	100 %	0 %	0 %	0 %	116332448
47	NC_008511	TGAA	2	8	3011	3018	50 %	25 %	25 %	0 %	116332449
48	NC_008511	AAG	2	6	3096	3101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332449
49	NC_008511	ATT	2	6	3114	3119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332449
50	NC_008511	TTTC	2	8	3223	3230	0 %	75 %	0 %	25 %	116332449
51	NC_008511	TTCGA	2	10	3240	3249	20 %	40 %	20 %	20 %	116332449
52	NC_008511	ATGG	2	8	3257	3264	25 %	25 %	50 %	0 %	116332449
53	NC_008511	A	6	6	3315	3320	100 %	0 %	0 %	0 %	116332449
54	NC_008511	GATC	2	8	3502	3509	25 %	25 %	25 %	25 %	116332449
55	NC_008511	AGG	2	6	3537	3542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332449
56	NC_008511	TTC	2	6	3563	3568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332449
57	NC_008511	T	6	6	3637	3642	0 %	100 %	0 %	0 %	116332449
58	NC_008511	TATT	2	8	3658	3665	25 %	75 %	0 %	0 %	116332449
59	NC_008511	GAT	2	6	3674	3679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332449
60	NC_008511	ATT	2	6	3694	3699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332449
61	NC_008511	GGA	2	6	3700	3705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332449
62	NC_008511	CGTT	2	8	3763	3770	0 %	50 %	25 %	25 %	116332449
63	NC_008511	CGCC	2	8	3784	3791	0 %	0 %	25 %	75 %	116332449
64	NC_008511	A	8	8	3800	3807	100 %	0 %	0 %	0 %	116332449
65	NC_008511	CCTT	2	8	3898	3905	0 %	50 %	0 %	50 %	116332449
66	NC_008511	GGAG	2	8	3961	3968	25 %	0 %	75 %	0 %	116332449
67	NC_008511	CGA	2	6	3989	3994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332449
68	NC_008511	TTG	2	6	4026	4031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332449
69	NC_008511	GTT	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332449
70	NC_008511	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332449
71	NC_008511	AAG	2	6	4248	4253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332449
72	NC_008511	ACG	2	6	4272	4277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332449
73	NC_008511	A	6	6	4301	4306	100 %	0 %	0 %	0 %	116332449
74	NC_008511	CTG	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332449
75	NC_008511	AAG	2	6	4423	4428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332449
76	NC_008511	TTC	2	6	4438	4443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332449
77	NC_008511	AAG	2	6	4536	4541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332449
78	NC_008511	CGT	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332449
79	NC_008511	CGA	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332449
80	NC_008511	TCC	2	6	4792	4797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332449
81	NC_008511	AGG	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332449
82	NC_008511	TGG	2	6	4975	4980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116332449
83	NC_008511	TTCC	2	8	5031	5038	0 %	50 %	0 %	50 %	116332449
84	NC_008511	T	6	6	5144	5149	0 %	100 %	0 %	0 %	116332449
85	NC_008511	CGG	2	6	5160	5165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332449
86	NC_008511	CGG	2	6	5268	5273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332449
87	NC_008511	G	6	6	5306	5311	0 %	0 %	100 %	0 %	116332449
88	NC_008511	TTGG	2	8	5314	5321	0 %	50 %	50 %	0 %	116332449
89	NC_008511	CAG	2	6	5430	5435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332449
90	NC_008511	A	6	6	5541	5546	100 %	0 %	0 %	0 %	116332450
91	NC_008511	TCC	2	6	5600	5605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332450
92	NC_008511	CGG	2	6	5696	5701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332450
93	NC_008511	ATT	2	6	5749	5754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332450
94	NC_008511	TTC	2	6	5831	5836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332450
95	NC_008511	GGT	2	6	5907	5912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116332450
96	NC_008511	TCATT	2	10	5932	5941	20 %	60 %	0 %	20 %	116332450
97	NC_008511	GGT	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116332450
98	NC_008511	GAA	2	6	6018	6023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332450
99	NC_008511	GGAC	2	8	6058	6065	25 %	0 %	50 %	25 %	116332450
100	NC_008511	T	8	8	6082	6089	0 %	100 %	0 %	0 %	116332450
101	NC_008511	CTT	2	6	6175	6180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332450
102	NC_008511	TTCG	2	8	6199	6206	0 %	50 %	25 %	25 %	116332450
103	NC_008511	TC	3	6	6231	6236	0 %	50 %	0 %	50 %	116332450
104	NC_008511	AAG	2	6	6250	6255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332450
105	NC_008511	AGA	2	6	6282	6287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332450
106	NC_008511	TTGC	2	8	6321	6328	0 %	50 %	25 %	25 %	116332450
107	NC_008511	AATC	2	8	6363	6370	50 %	25 %	0 %	25 %	116332450
108	NC_008511	A	6	6	6768	6773	100 %	0 %	0 %	0 %	116332451
109	NC_008511	GAA	2	6	6795	6800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332451
110	NC_008511	CAA	2	6	6903	6908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332451
111	NC_008511	GTT	2	6	6953	6958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332451
112	NC_008511	AGA	2	6	6997	7002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332451
113	NC_008511	TTTC	2	8	7011	7018	0 %	75 %	0 %	25 %	116332451
114	NC_008511	TCC	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332451
115	NC_008511	TTC	2	6	7144	7149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332451
116	NC_008511	ATA	2	6	7182	7187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332451
117	NC_008511	TATCG	2	10	7203	7212	20 %	40 %	20 %	20 %	116332451
118	NC_008511	GTC	2	6	7231	7236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332451
119	NC_008511	AGA	2	6	7256	7261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332451
120	NC_008511	T	7	7	7293	7299	0 %	100 %	0 %	0 %	116332451
121	NC_008511	ATT	2	6	7318	7323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332451
122	NC_008511	T	6	6	7327	7332	0 %	100 %	0 %	0 %	116332451
123	NC_008511	TTC	2	6	7356	7361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332451
124	NC_008511	GCG	2	6	7415	7420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332451
125	NC_008511	AAAG	2	8	7421	7428	75 %	0 %	25 %	0 %	116332451
126	NC_008511	AAT	2	6	7505	7510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332451
127	NC_008511	GAT	2	6	7533	7538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332451
128	NC_008511	A	6	6	8023	8028	100 %	0 %	0 %	0 %	116332452
129	NC_008511	TGT	2	6	8101	8106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332452
130	NC_008511	AAT	2	6	8111	8116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332452
131	NC_008511	TTC	2	6	8193	8198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332452
132	NC_008511	GAA	2	6	8249	8254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332452
133	NC_008511	AT	3	6	8294	8299	50 %	50 %	0 %	0 %	116332452
134	NC_008511	TGG	2	6	8311	8316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116332452
135	NC_008511	A	6	6	8367	8372	100 %	0 %	0 %	0 %	116332452
136	NC_008511	T	6	6	8386	8391	0 %	100 %	0 %	0 %	116332452
137	NC_008511	AGG	2	6	8403	8408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332452
138	NC_008511	TC	3	6	8417	8422	0 %	50 %	0 %	50 %	116332452
139	NC_008511	TG	3	6	8498	8503	0 %	50 %	50 %	0 %	116332452
140	NC_008511	ATC	2	6	8507	8512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332452
141	NC_008511	TTTTC	2	10	8548	8557	0 %	80 %	0 %	20 %	116332452
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143	NC_008511	CTT	2	6	8621	8626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332452
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262	NC_008511	TTTC	2	8	14299	14306	0 %	75 %	0 %	25 %	116332458
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264	NC_008511	TA	3	6	14590	14595	50 %	50 %	0 %	0 %	116332458
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267	NC_008511	A	6	6	14645	14650	100 %	0 %	0 %	0 %	116332458
268	NC_008511	GAT	2	6	14720	14725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332459
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272	NC_008511	TCC	2	6	14914	14919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332459
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389	NC_008511	AAG	2	6	20478	20483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332464
390	NC_008511	TTC	2	6	20514	20519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332464
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393	NC_008511	A	6	6	20655	20660	100 %	0 %	0 %	0 %	116332464
394	NC_008511	GAA	2	6	20701	20706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332464
395	NC_008511	TTTTG	2	10	20827	20836	0 %	80 %	20 %	0 %	116332464
396	NC_008511	T	6	6	20924	20929	0 %	100 %	0 %	0 %	116332464
397	NC_008511	ACC	2	6	20985	20990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116332464
398	NC_008511	T	8	8	21035	21042	0 %	100 %	0 %	0 %	116332464
399	NC_008511	AGGAAG	2	12	21078	21089	50 %	0 %	50 %	0 %	116332464
400	NC_008511	GATT	2	8	21164	21171	25 %	50 %	25 %	0 %	116332464
401	NC_008511	AGA	2	6	21190	21195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332464
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403	NC_008511	GTT	2	6	21391	21396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332465
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